底滤缸最佳水流循环方式是：底滤为滤材提供的空间最大，所以处理能力是最强的(注意不是效率)，有利于硝化细菌的培养，一般来说底滤有3格或者4格，滤材的摆放顺序为：第一格，白棉、藤棉，第二格;细菌屋、陶瓷环、玻璃环、滤球等(可以选一种，也可以搭配使用);第三格，如果是最后一格，则可以放泵和加热棒，如果不是，也可以放细菌屋等或是麦饭石;但是最后需要留一格放泵和加热棒。

过滤系统是由动力源，水质过滤，箱体和细菌组合而成的统称：过滤系统;动力源就是指水泵，利用水泵转子的转动带到整个过滤系统的水循环;水质过滤就是指滤材，通过物理和生化两种滤材组合而成，是作为细菌寄生和繁殖的地方;箱体就是指承载这些滤材的容积，也就是过滤箱。一般会使用塑料箱或者玻璃缸;细菌主要是指硝化细菌，但一个过滤里只有硝化细菌是不够的。还有其它异营菌在帮忙过滤。