土卫六上的甲烷，基本上不是在土卫六成为星球之后才形成的，而是当初形成土卫六的原料中就有大量的甲烷。

甲烷在宇宙中是一种相当常见的物质，在那些最终可能形成恒星及其行星、卫星系统的星云中是普遍存在的。

宇宙中的元素，主要是氢(大约占3/4)和氦(大约占1/4)，其余成分相对氢和氦是非常少的，在这少量的元素中，相对较多的依次是：氧、碳、氖、氮、镁、硅、铁、硫……

在星云中，物质的密度其实是非常低的，比人类在地球上制造的真空密度还要低，因此这些元素的原子并没有太多的机会遇到另一个原子从而形成分子，多数都是以单原子存在。而在一些附近存在强烈辐射源的星云中，元素甚至以电离的核与自由的电子的形态(等离子态)存在(参见维基百科：电离氢区)。

尽管密度如此之低，但由于数量极其巨大，所以总会有一些原子找到了“另一半”，结合成分子。从宇宙元素的丰度可以显而易见地知道，宇宙中最普遍的分子必定是H2;氦是独身主义者，它不会与其它原子结合。