1、定义不同

正刊，英文称为regular issue，是指一个期刊每年一卷几期，发表的几期论文都没有一个特定的主题，互相之间没有影响。

专刊，英文称为Special Issue，是指某个特定研究方向的征稿活动，一般是有学术圈内有影响力的专家针对最新研究热点征集一批具有最新研究成果的稿件集中在期刊某期或者分散在期刊各期上进行发表。

2、SCI论文主题限定

SCI正刊上发表的论文，是符合本期刊选题方向的。一本SCI期刊的选题方向，会细分为不同的小方向，但是哪一个小方向是没有限制的。即正刊上的论文，只有选题方向限制，没有主题限制。

SCI专刊上发表的论文，必须有特定的主题，比如发表一期关于新冠肺炎的文章，本期所有版面，刊登的所有文章，都必须与新冠肺炎有关。

3、SCI正刊有卷号和期号，专刊可以没有期号

发表SCI正刊或专刊，都要安排版面。当专刊占正刊的某一期时，则专刊有卷号和期号。